В categ_.db - только удаленные, неиспользуемые.
Используемые должны быть в файле categ.db, без подчеркивания в названии.
Так что, по идее, categ_.db можно со спокойной душой заменить чистым из дистрибутива. Проделайте это при закрытой смене и все должно быть хорошо.